公元2059年，人类乘坐超长距离移民船团“Macross Frontier”航向银河中心。顶级偶像雪露·诺姆来到船团举办演唱会，憧憬她的普通女高中生兰花·李也因此卷入一场改变命运的相遇。与此同时，出身飞行员世家的早乙女阿尔特正为自己的未来感到迷茫，并在偶然中与兰花结识。就在演唱会举行之际，船团突然遭到神秘宇宙生命体“Vajra”的袭击，平静生活瞬间崩塌。面对强敌入侵，民间军事组织SMS驾驶可变战机迎战，阿尔特也被卷入战斗前线。随着危机不断升级，雪露、兰花与阿尔特三人之间逐渐形成复杂而微妙的情感关系。歌声、战机与战争交错推进，隐藏在兰花身世和敌人来历背后的真相，也一步步浮出水面。