《神奇阿呦之最强流星人》承接前作剧情展开。为了帮助小米解决意外留下的颜料问题，阿呦前往其他星球，却因此牵出新的麻烦：被利用善意逃脱的机器流星人，引来了真正的流星人阿巴。阿呦将阿巴带回小米家，希望大家能够接纳这位来自宇宙的新朋友，但阿巴活泼吵闹的性格很快打乱了日常生活。误解与不适应接连出现，让阿巴感受到实现他人愿望并没有想象中容易，也渐渐萌生了返回宇宙的念头。故事在轻松幽默的氛围中，讲述伙伴之间的理解、包容与成长。