在文明过度发展后的未来，地球经历了剧烈变化。人类为集中利用资源，纷纷迁入封闭的“园顶都市”，把更适宜生存的土地让给自然万物。然而，一股主张离开都市、重返故土的“返乡运动”正在世界各地悄然兴起。生活在西伯利亚园顶都市的少年盖那，原本只是个擅长虚拟对战游戏的普通学生，对返乡主义也抱有疑虑。一次意外中，他被铁道警备队拘捕，并在拘留中结识了神秘而坚定的男子盖恩。受对方影响，盖那决定一同越狱，并潜入权贵的收藏库，夺取名为“机神人”的强大战斗机体。为了冲破警备队的围追堵截，盖那第一次驾驶真实机体投入战斗，也由此被卷入更庞大的返乡计划。随着旅程展开，他不仅要面对强敌与阴谋，还将重新思考人与自然、秩序与自由之间的关系。